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ニュース｜ キャンペーン
2025.10.24
バイオインフォマティクス・トレーニングキャンペーン

バイオインフォマティクス・トレーニングキャンペーン

キャンペーン期間：2025年11月1日（土）～2026年2月28日（土）

体系的に学べる

体系的に学べる

実践的なコマンド実習

実践的なコマンド実習

プロに質問できる

プロに質問できる
対象期間 2025年11月1日（土）～2026年2月28日（土）
キャンペーン対象 スタンダードコース、オンデマンド実習プラン（単科目）
キャンペーン内容 希望小売価格から10％OFF
実施形式 オンライン
注意事項 訪問・同時双方向型トレーニングは対象外

スタンダードコース詳細

基礎２科目（Linux＋R）＋応用１科目（RNA-seq解析・シングルセルRNA-seq解析・空間的遺伝子発現解析から選択）の、お得な価格で体系的な学びをご提供するスタンダードコースです。

コース 内容 価格（税抜）
RNA-seq解析 Linux、R、RNA-seq解析（動画視聴＋サーバ実習）
ハンズオン質問会（科目毎1回）		 20万円
18万円/名
シングルセルRNA-seq解析 Linux、R、シングルセルRNA-seq解析（動画視聴＋サーバ実習）
ハンズオン質問会（科目毎1回）		 24万円
21.6万円/名
空間的遺伝子発現解析 Linux、R、空間的遺伝子発現解析（動画視聴＋サーバ実習）
ハンズオン質問会（科目毎1回）		 30万円
27万円/名

こんな課題を解決しました

科目詳細

科目 科目詳細 標準
学習時間		 単科目価格
（税抜）
Linux

・Linuxの概要

・ディレクトリ構造、ファイルやディレクトリの作成・コピー・移動・削除、絶対パスと相対パス、アクセス権限、ファイル内容の加工

・ソフトウェアのダウンロード・インストール

 300分
（動画48分） 		6万円
5.4万円
R

・起動・終了、基本的演算（四則計算など）、変数の取り扱い、オブジェクトの取り扱い、ベクトル・リスト・マトリクス・データフレームの取り扱い

・基本統計量の計算、作図

・パッケージのインストール・読み込み

 300分
（動画74分） 		6万円
5.4万円
RNA-seq解析

・NGS基礎知識と主なファイル形式

・公開データの取得方法

・RNA-seq解析：クオリティチェックとクオリティコントロール、マッピング、発現定量、正規化、発現変動遺伝子の検出、結果の可視化、発現定量と発現比較、GOエンリッチメント解析、パスウェイエンリッチメント解析

 360分
（動画74分） 		8万円
7.2万円
シングルセル
RNA-seq解析

・シングルセルRNA-seq解析基礎知識と解析の流れ

・Seuratを用いた解析：データの読み込み、クオリティコントロール、正規化、フィルタリング、データのスケーリングとノイズの除去、次元削減、下流解析で使用する主成分軸数の決定、クラスタリングと結果の可視化、マーカー遺伝子探索、統合解析

 420分
（動画60分） 		12万円
10.8万円
シングルセル
RNA-seq解析【発展】

・擬似系譜解析：monocle3のインストール、発現マトリクス読み込み、正規化、次元削減、クラスタリング可視化、Trajectory Graphの構築、Pseudotime順に細胞を並べる、Trajectoryとともに発現変化する遺伝子の探索

・velocity解析：velocytoのインストール、RNA velocity解析実行手順、擬似系譜解析との比較

 420分
（動画58分） 		10万円
9万円
空間的
遺伝子発現解析

・空間的遺伝子発現解析基礎知識と解析の流れ

・Seuratを用いた解析：クオリティコントロール・正規化、次元削減・クラスタリング・細胞のプロット、マーカー遺伝子探索・発現量の視覚化、空間座標の抽出、データ統合、GOエンリッチメント解析

 480分
（動画144分） 		18万円
16.2万円
2025.10.23
シングルセル遺伝子発現Flex｜WET&DRY

シングルセル遺伝子発現Flex WET&DRY

論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
まで込みのスペシャルプライス

4サンプル180万円（税抜）
※基礎解析プランの場合

サービス内容

【WET】シングルセル遺伝子発現Flex
○ 10x Genomics社 Chromium Single Cell Gene Expression Flexによるライブラリ調製
○ 1～8サンプルをまとめてエマルジョン形成。1サンプルあたり最大2万細胞の解析が可能。
○ Illumina社 NovaSeq™ X Plusによるシーケンシング（約100 million read pair/sample）
○ Cell Rangerによる発現定量（1検体あたり最大 2万細胞）
【DRY】データ解析（基礎解析プラン）
○ クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよび UMAP上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化（Feature plot, Violin plot）、サンプル間比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
○ 解析レポート、結果データ一式の納品

データ解析内容

基礎解析プランで提供可能な解析結果

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ：固定分散済み細胞

  • 由来は、細胞懸濁液、新鮮組織、凍結組織、FFPE組織、PFA固定組織などが可能です。
  • GEM-X Flex Sample Preparation v2 Kitでの固定が必須です。
  • 詳細はお問い合わせください。
  • ※ 生物種はヒトおよびマウスになります。
  • ※ 受注単位は1~8サンプルとなります。
  • ※ カスタムプローブも対応可能です(事前相談必要)
  • ※ プローブを使用して RNAを検出するため、従来法より高感度ですが、配列情報の取得はできません。
  • ※ DRY（データ解析）のみの場合、発現マトリクス（cellranger 出力結果）から受付いたします。それ以外の形式をお持ちの場合はご相談ください。

価格表（税抜）

製品名 単価（税抜）
シングルセル遺伝子発現Flex 180万円/4サンプル
シングルセルRNA-seq解析 62万円/サンプル
データ解析のみ 14万円/サンプル
選べるデータ解析プラン
2025.10.22
シングルセルRNA-seq解析｜WET&DRY
シングルセルRNA-seq解析｜WET&DRY【受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
まで込みのスペシャルプライス

62万円/サンプル（税抜）
※1～3サンプル＆基礎解析プランの場合、
詳細は価格表をご参照ください

サービス内容

【WET】シングルセルRNAシーケンス
○ 10x Genomics社 Chromiumによるライブラリ調製
○ Illumina社 NovaSeq™ X Plus による120Gbのシーケンシング
○ Cell Rangerによる発現定量
【DRY】データ解析（基礎解析プラン）
○ クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよび UMAP上の可視化、クラスタごとの　特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化（Feature plot, Violin plot）、サンプル間比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
○ 解析レポート、結果データ一式の納品

データ解析内容

基礎解析プランで提供可能な解析結果

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ：細胞

  • 凍結状態であること。
  • 細胞数は106細胞以上であること。
  • 融解後の細胞の生存率が90%以上推奨。
  • 細胞は分散してください。
  • EDTA0.1mM以下、マグネシウム3mM以下、界面活性剤は含まないこと。
  • 細胞サイズが直径30μm以下であること。
  • 40μmのフィルターにかけてください。
  • 凍結の際にはセルバンカー等を用いてください。
  • ※ ヒトおよびマウス、ラット以外の生物種をご希望の場合は、お問合せください。
  • ※ シングルセル遺伝子発現解析では、機器を持ち込んでの出張ライブラリ調製サービスも承っております。また、提携ラボにサンプルを持ち込んで頂いてのご利用も可能です。詳細はお問合せください。
  • ※ DRY（データ解析）のみの場合、発現マトリクス（cellranger 出力結果）から受付いたします。それ以外の形式をお持ちの場合はご相談ください。

価格表（税抜）

製品名 単価（税抜）
シングルセルRNA-seq解析 62万円/サンプル
シングルセル遺伝子発現Flex 180万円/4サンプル
データ解析のみ 14万円/サンプル
選べるデータ解析プラン
　※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
2025.10.17
空間的遺伝子発現解析｜WET&DRY
空間的遺伝子発現解析｜WET&DRY【受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
パスウェイ･GO解析
擬似系譜解析
解釈支援の報告会2回
まで込みのスペシャルプライス



280万円/2サンプル
※Visium HDの場合

サービス内容（Visium HDの場合）

【WET】空間的遺伝子発現解析
○ FFPEブロックからのスライド作製（凍結切片は提携会社へ依頼）、HE染色、切片からのRNA抽出・品質検定（DV200％測定）
○ Visium CytAssist（10x Genomics社）を用いたライブラリー作製
○ Illumina社 NovaSeq™ X PlusもしくはMGI社DNBSEQ-G400RSによるシーケンス
【DRY】データ解析
○ 発現定量解析（クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよびUMAP上の可視化・空間座標上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化（Feature plot, Violin plot））
○ サンプル間比較解析（各クラスタにおけるサンプル間発現比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析）
○ 擬似系譜解析（Cell trajectoryの推定、Pseudotime の推定、着目遺伝子の発現パターン可視化）
○ 解析レポート、報告会（2回実施、手法解説、結果解釈のディスカッション）、アフターフォロー（メールでのQ&A）

データ解析内容

解析結果

対応プラットフォーム一覧

製品名 サンプルタイプ 対応生物種 受付単位
Trekker™ 新鮮凍結組織、OCT包埋組織/td> ヒト、マウス、ラット
その他の真核生物は要事前相談		 2サンプル
Xenium 5K FFPE組織スライド ヒト、マウス 2サンプル
Visium HD FFPEブロック、FFPEスライド ヒト、マウス 2サンプル
※Stereo-seq™、CosMx™等も対応可能です。
※プラットフォーム毎にサンプル要件、注意事項が異なりますので、お問い合わせください。

価格表（税抜）

製品名 単価（税抜）
Trekker™ 320万円/2サンプル
Xenium 5K 500万円/2サンプル
Visium HD 280万円/サンプル
データ解析のみ 43万円/サンプル
2025.10.17
WES/WGS遺伝性変異解析｜WET&DRY
WES/WGS遺伝性解析 WET&DRY【受託解析キャンペーン】

シーケンスから
解釈支援の報告会
まで込みのスペシャルプライス

7.3万円/サンプル
※WES遺伝性変異解析の場合の価格、詳細は価格表をご参照ください

サービス内容

【WET】DNAシーケンス
○ ライブラリ調製
○ Illumina社 NovaSeq™ X Plusによるシーケンシング
【DRY】データ解析
○ クオリティコントロール, マッピング、変異(SNV/InDel)検出, アノテーション・スクリーニング
○ 使用するDB：snpEff, dbSNP, gnomAD, ClinVar, PROVEAN, SIFT
○ エクセルで閲覧可能なTSVへの変換
○ サンプル間の遺伝形式（genotype）比較
○ 遺伝形式による変異の抽出（トリオ解析など）
○ 解析レポート, 報告会 (手法解説, 結果解釈のディスカッション) , アフターフォロー（メールでのQ&A）

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ 総量（ng） 液量（µL） 濃度（ng/µL） 純度
genomic DNA 300以上 15以上 20以上 OD260/280 = 1.8-2.2
no degradation,
no contamination
FFPE DNA 500以上 - - Fragments should be longer than 1000 bp
cfDNA 30以上 - - Fragments should be in multiples of 170 bp no genomic contamination
  • ※ 生物種：ヒト
  • ※ FFPE DNA/cfDNAの場合は都度ご相談ください。

データ解析内容

解析結果

価格表（税抜）

製品名 単価（税抜）
WES遺伝性変異解析（Agilent SureSelect V6, 6Gb） 7.3万円/サンプル
WGS遺伝性変異解析（NovaSeq™ X, 90Gb） 19.5万円 / サンプル
2025.10.16
RNA-seq解析｜WET&DRY
RNA-seq WET&DRY【受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
Gene Ontology解析
パスウェイ解析
まで込みのスペシャルプライス

2.0万円/サンプル（税抜）
※DNBSEQ™、polyA選択、4Gb、基礎解析プランの場合の価格、詳細は価格表をご参照ください

サービス内容

【WET】RNAシーケンス
○ ライブラリ調製
○ BGI社 DNBSEQ™によるシーケンシング（PolyA 4Gb）
【DRY】データ解析（基礎解析プラン）
○ 発現定量解析：マッピング、発現定量、階層的クラスタリング (ヒートマップ描画)、 主成分分析
○ 二群間の発現量比較解析（サンプル数によって組み合わせ数を決定）：Volcano plot
○ エンリッチメント解析：Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
○ 解析レポート、結果データ一式の納品

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ：total RNA

総量（ng） 液量（µL） 濃度（ng/µL） RIN値 純度
200以上 10以上 20以上 4.0以上
with flat base line 		OD260/280 = 1.8-2.2
OD260/230 ≥ 1.8
no degradation,
no contamination
  • ※ サンプルQCでRNA総量またはRIN値が非常に低い場合は、再提出をお願いすることがございます
    （再提出1回まで無償対応）
  • ※ シーケンシングは日本（NovaSeq™:真核生物のみ）またはシンガポール・中国にて実施します
  • ※ 対応生物種：ヒト・マウス・ラット
    その他の生物種はご相談ください（DRY:9万円/回の追加料金）
  • ※ 原核生物の場合、WET:1.5万円/サンプルの追加料金
  • ※ RNA抽出からご依頼時
    料金：1.2 万円/サンプルの追加料金（原核生物は別途見積）
    サンプル要件： 分離細胞1.0×105 細胞以上、組織切片10-30 mg
  • ※ DRY（データ解析）のみの場合、FASTQファイル（生データ）から受付いたします

データ解析内容

解析結果

価格表（税抜）

製品名 単価（税抜）
DNBSEQ™（polyA選択、4Gb） 2.0万円/サンプル
NovaSeq™（ストランド特異的、polyA選択、6Gb） 2.7万円/サンプル
NovaSeq™（ストランド特異的、polyA選択、9Gb） 3.0万円/サンプル
データ解析のみ 1.0万円/サンプル
選べるデータ解析プラン
2025.10.03
秋の受託解析キャンペーン

【受託解析キャンペーン】

キャンペーン期間：2025年10月6日（月）～2026年3月18日（水）　サンプル受領まで

「データ解析込み」でこの価格、更にボリュームディスカウントも対応

RNA-seq解析　基礎解析プラン（GO解析、パスウェイ解析まで）
製品名 単価（税抜）
DNBSEQ™（polyA選択、4Gb） 2.0万円/サンプル
NovaSeq™（ストランド特異的、polyA選択、6Gb） 2.7万円/サンプル
NovaSeq™（ストランド特異的、polyA選択、9Gb） 3.0万円/サンプル
データ解析のみ 1.0万円/サンプル
シングルセル解析　基礎解析プラン（GO解析、パスウェイ解析まで）
製品名 単価（税抜）
シングルセル遺伝子発現Flex 180万円/4サンプル
シングルセルRNA-seq解析 62万円/サンプル
データ解析のみ 14万円/サンプル
空間的遺伝子発現解析
製品名 単価（税抜）
Trekker™
【真のシングルセル（核）解像度｜全ての真核生物に対応可能｜全遺伝子を検出可能】 		320万円/2サンプル
Xenium 5K 500万円/2サンプル
Visium HD 280万円/サンプル
データ解析のみ 43万円/サンプル
がん変異解析
製品名 単価（税抜）
WESがん変異解析（Agilent SureSelect V6, 正常組織 6Gb, 腫瘍組織 12Gb） 11.5万円/症例(1ペア)
WGSがん変異解析（NovaSeq™ X, 正常組織 90Gb, 腫瘍組織 90Gb） 39.0万円/症例(1ペア)
遺伝性変異解析
製品名 単価（税抜）
WES遺伝性変異解析（Agilent SureSelect V6, 6Gb） 7.3万円/サンプル
WGS遺伝性変異解析（NovaSeq™ X, 90Gb） 19.5万円 / サンプル

キャンペーン対象のデータ受託解析メニュー

選べるデータ解析プラン

基礎解析プラン

解析名 解析内容
RNA-seq解析 発現定量解析、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析
シングルセル解析 クオリティコントロール、 データ統合、 クラスタリング、 クラスタごとの特徴遺伝子の探索、 発現量可視化、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析

標準解析プラン

選べるデータ解析プラン

報告会とアフターサポート【データ解析者の視点で研究支援】
・レポート：経験豊富な解析担当者が研究目的を踏まえた所感を添えたレポートを提供します。
・報告会：解析結果の解釈に関して解析担当者からの報告とディスカッションを行います。
・アフターサポート：報告会後 １ヵ月間、メールでのQA対応や図の調整を行います。

解析名 解析内容
RNA-seq解析 発現定量解析、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析
シングルセル解析 クオリティコントロール、 データ統合、 クラスタリング、 クラスタごとの特徴遺伝子の探索、 発現量可視化、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析、 特定クラスタに着目した解析（再次元削減、サブクラスタリング、二群間比較、擬似系譜解析）
空間的遺伝子発現解析 クオリティコントロール、 データ統合、 クラスタリング、 クラスタごとの特徴遺伝子の探索、 発現量可視化、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析、 特定クラスタ、座標に着目した解析（再次元削減、サブクラスタリング、二群間比較、擬似系譜解析）
がん変異解析 がん変異の検出、 De novo mutation signature 解析、 Oncoplot、 新規Driver gene候補推定
遺伝性変異解析 アノテーション、 遺伝形式による変異の抽出

▼データ解析の専門家による報告会の様子をご覧ください▼

コンサルティングプラン

【専門家チームと密に協議し研究目的に応じたデータ解析を実現】
・研究テーマとゴールを共有し、解析計画を策定し提案します。
・2～3週間のサイクルで協議を重ね、常に計画を最適化しながら柔軟に解析を進めます。

  ・議論を繰り返しながら、目的に応じた最適な解析方法を提案、実施します。
・解析途中で生じた課題に対して、解決方法を提案、実施します。
・High impact な論文にも耐えうる水準のレポートを提供します。

　※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
2025.01.27
バイオインフォマティクス・トレーニング「新科目リリースキャンペーン」
バイオインフォマティクス・トレーニング「新科目リリースキャンペーン」

【新科目】 　エッセンシャル動画視聴プラン

　大学・研究所の医師や研究者、企業の研究職のみなさまの独学を支援するための新プラン「エッセンシャル動画視聴プラン」をリリースいたしました。
　データ解析に役立つLinuxとRの基礎知識と活用イメージを学び、今後の研究推進に必要な技術か検討できます。

受講イメージ

入門のためのエッセンシャル動画視聴プランから、
実践のオンデマンド実習プランへ、習熟度に合わせて学習を進められます。

＜オンデマンド実習プラン＞


◆すぐにコマンドを実践できる
インターネット環境さえあれば、すぐにトレーニング用解析環境をご提供。
コマンド理解とサーバ実習のセットで段階的に学びを深め バイオインフォマティクスを実践できます。

◆現役バイオインフォマティシャンに質問できる
トレーニング内容のわからないこと、上手くいかないコマンドを 実際にデータ解析をしている現役バイオインフォマティシャンにハンズオン形式で質問できます。

トレーニングオンデマンド受講のイメージ

キャンペーン詳細

オンデマンド実習プラン追加お申込みすれば
Linux & R エッセンシャル動画視聴プラン
実質無料！

対象期間 2025年1月27日（月）～2月28日（金）
キャンペーン対象 対象期間内にLinux & R エッセンシャル動画視聴プランをご発注された方
実施形式 オンデマンドサイトでの受講
注意事項 Linux & R エッセンシャル動画視聴プランのご発注日より、3ヶ月以内にオンデマンド実習プランにお申込みいただくと、1科目のみ5,000円割引(税抜)でご提供いたします。

Linux & R エッセンシャル動画視聴プランをクレジットカードまたは銀行振込で購入希望の方は、上記「Linux & Rご購入はこちら」ボタンよりお進みください。ご購入には、弊社学習サイト「バイオインフォマティクス・トレーニングオンデマンド」への会員登録が必要です。

▼トレーニングオンデマンドの体験動画をご視聴ください！▼

プラン詳細

＜エッセンシャル動画視聴プラン＞

科目 学習内容 学習方式 価格（税抜）
Linux ・Linuxの概要、ディレクトリ構造、絶対パスと相対パス
・ディレクトリ移動、ファイル操作・加工などの15コマンド
・ソフトウェアのインストール（PLINK）		 動画視聴
（45分）
確認テスト		 5,000円
R ・Rの概要、基本的な操作方法
・演算、変数と代入、データ型とデータ構造
・作図のサンプルコマンド紹介、パッケージインストール 		動画視聴
（32分）
GWAS ・GWASの概要と論文事例、SNPアレイ解析
・ケースコントロール解析と量的形質関連解析
・SNPインピュテーション、PRS解析 		動画視聴
（63分）		 5,000円

＜オンデマンド実習プラン＞

科目 学習内容 学習方式 価格（税抜）
Linux エッセンシャル動画視聴プランの内容に加えて
・アクセス権限変更等の追加10コマンド紹介と実習
・BLAST、Samtoolsのインストール 		・動画視聴（48分）
・サーバ実習（33問）
・ハンズオン質問会 		60,000円
R エッセンシャル動画視聴プランの内容に加えて
・各データ構造の各種関数、基本統計量の解説と実習
・箱ひげ図、ヒストグラム、散布図等の解説と実習
・カテゴリ単位の処理、スクリプトファイル読込 		・動画視聴（74分）
・サーバ実習（34問）
・ハンズオン質問会 		60,000円
RNA-seq 【発現変動遺伝子の検出、二群間比較】
・QCからGO・パスウェイエンリッチメント解析
　までの実践的な実習 		・動画視聴（74分）
・公開データ解析実習
・ハンズオン質問会 		80,000円
シングルセル
RNA-seq
【Seurat】		 【Seuratを用いたシングルセルRNA-seq解析技術】
・クラスタリングやマーカー遺伝子探索と
　セルタイプ同定などの実践的な実習 		・動画視聴（60分）
・公開データ解析実習
・ハンズオン質問会 		100,000円
シングルセル
RNA-seq
発展		 【擬似系譜解析とvelocity解析】
・monocleを用いたtrajectory解析の解説と実習
・velocytoを用いたRNA velocity解析の解説と実習 		・動画視聴（58分）
・公開データ解析実習
・ハンズオン質問会 		100,000円
※学習期間（動画視聴・サーバ実習）は全プラン共通で２週間となります。

お客様の声

平日の昼間は忙しく、突発的なオペがあったりと学習時間を確保できなかったが、オンデマンド動画で日曜、祝日、夜間など自分の都合の良い時間に学習できた。

大学臨床研究医

臨床研究医
整備されたサーバ上でデータ解析を繰り返し実習でき、トライ＆エラーで理解度が上がってよかった。事前学習でつまづいた部分もあったが、ハンズオン質問会で解決できた。

大学臨床研究医

国立研究所研究員
2024.10.01
Xenium（空間的遺伝子発現解析）｜データ解析【受託解析キャンペーン】

空間的遺伝子発現解析（Xenium）データ解析【受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
パスウェイ･GO解析
擬似系譜解析
までをプロが支援

43万円/サンプル（税抜）
※1~3サンプルの場合
※他のプラットフォーム（Visium HD、Stereo-seq™
　CosMx™等）もWETから対応可能です。

▼データ解析の専門家による報告会の様子をご覧ください▼

データ解析内容

【発現定量解析】
○ クオリティコントロール
○ 正規化、データ統合
○ 次元削減
○ クラスタリングおよび UMAP上の可視化・空間座標上の可視化
○ クラスタごとの特徴遺伝子の探索
○ 着目遺伝子の発現量可視化（Feature plot, Violin plot）
【サンプル間比較解析】
○ 各クラスタおけるサンプル間発現比較解析
○ Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
【擬似系譜解析】
○ Cell trajectoryの推定
○ Pseudotimeの推定
○ 着目遺伝子の発現パターン可視化

受入れデータ・納品物

受入れデータ形式

  • 発現マトリクス
    ※ファイル形式を予めご教示ください
  • 組織切片画像およびイメージ処理済みデータ
  • 組織切片上の位置情報を含むデータ

納品物

  • 解析結果の中間報告資料（PDF）
  • 解析結果の最終レポート（PDF）
  • データ解析結果（PDF、Excel）

 

解析結果レポート例

バイオマーカー探索を目的としたデータ解析を実施した場合の報告書例です。研究目的に応じたご報告を行います。

解析結果レポート例

価格表（税抜）

製品名 単価
データ解析
（Xenium、Visium HD、Stereo-seq™、CosMx™）		 1~3サンプル 43万円/サンプル
4サンプル以上 都度見積
  • ※4サンプル以上はボリュームディスカウントが適用されますのでご相談ください。
  • ※1サンプル=1切片という考え方になります。1スライド上に多数の切片を乗せる場合があるため、ボリュームディスカウントは都度見積となります。

空間的遺伝子発現解析とは

　空間的遺伝子発現解析は、生物組織内の特定の部位における遺伝子発現の可視化を行う技術です。この技術は、2020年には約500件の研究論文が発表されていましたが、2023年にはその数が倍増し、今後もますます研究と応用の幅が広がっていくことが期待されています。
　この技術の特徴は、組織内の遺伝子発現を空間的に捉え、各スポットの遺伝子発現プロファイルを解析する点にあります。例えば、スポット間の遺伝子発現の差や、細胞間の相互作用を解析するために活用されています。従来のバルクRNA発現解析では、組織全体の平均的な遺伝子発現しか把握できませんでしたが、空間的遺伝子発現解析により、より高解像度な細胞レベルでの解析が可能となりました。

空間的遺伝子発現解析結果

技術の進化と利点

　従来のバルクRNA発現解析では、組織全体の遺伝子発現量を一括で解析するため、平均化されたデータしか得られませんでした。これに対して、シングルセルRNA解析では、個々の細胞の遺伝子発現パターンを把握することができ、細胞間の違いや介入前後の変化も詳細に解析できるようになりました。このシングルセルRNA解析の発展が、空間的遺伝子発現解析の登場へと繋がっています。
　さらに、空間的遺伝子発現解析では、2次元あるいは3次元情報を利用して組織内の遺伝子発現を解析します。これにより、組織内の微少環境解析や細胞間の相互作用を詳細に観察することが可能です。

代表的なプラットフォームとその特徴

　現在、空間的遺伝子発現解析のプラットフォームとして、CosMx™（NanoString Technologies社）、Visium HD・Xenium（10x Genomics社）、Stereo-seq™（MGI社）などが主に利用されています。これらのプラットフォームは、解析に使用する遺伝子数や解像度が異なるため、目的に応じた選択が求められます。

解析のポイント

　空間的遺伝子発現解析では、空間自己相関やホットスポット解析など、空間情報を考慮した解析手法を用いることで、遺伝子発現を組織画像上にマッピングするなど、空間情報を視覚的に表現することで、データの解釈が容易になります。
　組織の不均一性や実験操作によるノイズは、データ解析の精度を低下させる可能性があります。具体的には、ライブラリーサイズや遺伝子長などの影響を補正するために、適切な正規化方法を選択する必要があります。また、実験日や操作者などの違いによるバッチ効果を補正することで、データの信頼性を向上させることができます。
　細胞の種類を自動的に分類する手法もありますが、解釈には注意が必要です。既知のマーカー遺伝子の発現パターンと比較することで、細胞タイプの解釈の精度を高めることができます。また、シングルセルRNA-seqなど他のデータと統合することで、細胞タイプの解釈をより確実にすることができます。

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